號外，號外！來AG九游会J9集团晶典，FFPE樣本也能做單細胞測序啦！
福爾馬林固定石蠟包埋（Formalin Fixed Paraffin Embedded，FFPE）是醫學病理研究中保存臨(lin) 床組織樣本的標準方法，利用該方法存檔著大量生物樣品。FFPE 樣本承載著眾(zhong) 多疾病學信息，但因其 RNA 質量下降，轉錄本降解等原因，針對 FFPE 進行單細胞水平的研究一直困難重重。值得高興(xing) 的是，單細胞基因表達 Flex 技術（即單細胞 Fixed RNA）的出現解決(jue) 了 FFPE 樣本單細胞水平研究的難題，該技術使用探針雜交的方式，實現了在單細胞水平解鎖大量儲(chu) 存在醫院以及生物樣本庫中 FFPE 樣本的寶貴信息。
單細胞基因表達 Flex 技術利用包含上萬(wan) 個(ge) 特異性探針的專(zhuan) 用芯片來實現靶基因捕獲。在 FFPE 樣本經手動/自動化脫蠟解離後，芯片上帶 Probe Barcode 的探針與(yu) 獲得的細胞懸液進行雜交，探針上的 LHS 及 RHS 部分可直接捕獲靶基因，再通過 10x Genomics Chromium X 係統微流控通道與(yu) 含有 10x Barcode 的凝膠珠（Gel beads）結合，被油滴包裹形成油包水結構的微體(ti) 係（GEMs），從(cong) 而實現在單細胞水平上獲取FFPE樣本中保存的珍貴信息。
圖1 FFPE 樣本工作流程示意圖
目前，FFPE 樣本已經過多次實驗，選擇 15 個(ge) 不同類型人類組織 FFPE 樣本（包括人類肺癌、乳腺癌、睾丸FFPE樣本等），通過單細胞基因表達 Flex 技術進行單細胞轉錄組測序分析，最終獲得的基因數最高約 1500 個(ge) ，完全可以滿足後續細胞圖譜及差異表達等分析要求。具體(ti) 樣本類型、保存時間、樣本量、解離得到的細胞數等結果表現如下：
圖2 人體(ti) 組織 FFPE 樣本數據結果展示
圖3 浸潤性導管癌 FFPE 切片檢測得到的細胞類型、基因中位數等分析結果
作為(wei) 單細胞測序技術服務領域的佼佼者，AG九游会J9集团生物旗下AG九游会J9集团晶典在 2022 年取得了突出的成績。我們(men) 推出了單細胞基因表達 Flex（Fixed RNA）技術服務，解決(jue) 樣本的存儲(chu) 和運輸難題，實現了 FFPE 樣本開展單細胞測序的可能；引進了單細胞 CRISPR 篩選技術，通過分析數百個(ge) 不同的 CRISPR 擾動，了解某些基因的定量表達如何影響複雜的細胞表型和進程。更加值得稱讚的是，AG九游会J9集团晶典還補充了國有單細胞平台，自研了組織提核試劑盒，並強勢推出 CellScope 自有生信分析雲(yun) 平台，從(cong) 實驗和分析兩(liang) 個(ge) 層麵保障單細胞成果穩定產(chan) 出。2022年AG九游会J9集团晶典已經在單細胞及空間組學領域累計支持發文 130 餘(yu) 篇，總影響因子超過 2500 分，一年內(nei) 支持登頂三篇 Nature 期刊重磅文章！AG九游会J9集团晶典在單細胞方麵所做開拓性的產(chan) 品布局為(wei) 您的單細胞項目保駕護航，所取得的優(you) 異成績讓我們(men) 有充足的信心進一步服務好廣大客戶。
AG九游会J9集团晶典單細胞空間測序平台
AG九游会J9集团晶典支持單細胞測序文章分別發表在 Nature、Cell、Cancer Discovery、Circulation、Cell Stem Cell、Journal of Hepatology、Cell Research、Nature Immunology、Nature Cell Biology、GUT、Advanced Science 等期刊，應用領域涉及細胞圖譜繪製、類器官、生殖發育、幹細胞、血管老化、血管異質性、腫瘤異質性、腫瘤免疫治療、疾病機製研究等。
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